Mengungkap Lokus Resesif Spesifik Etnis untuk Penyakit Alzheimer pada 89 Keluarga Dominika Menggunakan Analisis WGS Berbasis Keluarga

Mengungkap Lokus Resesif Spesifik Etnis untuk Penyakit Alzheimer pada 89 Keluarga Dominika Menggunakan Analisis WGS Berbasis Keluarga

ABSTRAK
Bahasa Indonesia: Dalam sampel 89 keluarga Dominika dari Alzheimer’s Disease Sequencing Project (ADSP) milik National Institute on Aging, di mana sedikitnya satu anggota keluarga memiliki diagnosis penyakit Alzheimer (AD) yang dikonfirmasi, kami melakukan analisis sequencing genom keseluruhan resesif (WGS) eksploratori menggunakan pengujian asosiasi berbasis keluarga (FBAT-GEE). Metode ini menguji bersama-sama status afek dan usia saat onset di bawah mode pewarisan resesif. Analisis kami mengidentifikasi asosiasi signifikan di seluruh genom untuk rs847697 pada gen PDK2 pada kromosom 17, dekat dengan gen MAPT yang sebelumnya terlibat dalam AD melalui studi keterkaitan. Selain itu, kami mendeteksi empat lokus sugestif ( nilai- p < 1 × 10 −6 ). Mengingat kekuatan tak terduga dari asosiasi ini dalam ukuran sampel yang sederhana, kami meninjau kualitas data secara ketat, mengesampingkan artefak teknis. Asosiasi PDK2 didorong oleh sebagian kecil keluarga, yang sejalan dengan ekspektasi pewarisan resesif. Akan tetapi, hal itu tidak dapat direplikasi dalam kumpulan data AD lainnya termasuk Estudio Familiar de Influencia Genetica en Alzheimer (EFIGA), National Institute of Mental Health (NIMH), dan warga Amerika Eropa dari NIA ADSP, yang menunjukkan kemungkinan efek yang spesifik terhadap populasi atau terkait dengan keturunan. Studi ini menyoroti efektivitas pendekatan FBAT dalam mendeteksi asosiasi genetik unik dalam populasi yang lebih kecil dan terisolasi—temuan yang mungkin terdilusi dalam studi biobank yang lebih besar di mana populasi ini kurang terwakili.

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *